Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snai1Q02085 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms