Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms