Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms