Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EgfrQ01279 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EgfrQ01279 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms