Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HmgcrQ01237 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms