Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja5Q01231 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms