Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2cQ01098 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms