Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms