Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd80Q00609 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd80Q00609 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms