Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmmrQ00547 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HmmrQ00547 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms