Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax8Q00288 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms