Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb4P99026 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms