Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pitx2P97474 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pitx2P97474 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms