Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nbr1P97432 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nbr1P97432 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms