Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crmp1P97427 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crmp1P97427 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms