Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhodP97348 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhodP97348 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RhodP97348 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhodP97348 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhodP97348 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhodP97348 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhodP97348 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhodP97348 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhodP97348 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RhodP97348 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RhodP97348 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RhodP97348 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhodP97348 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhodP97348 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhodP97348 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RhodP97348 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhodP97348 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhodP97348 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhodP97348 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhodP97348 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhodP97348 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhodP97348 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhodP97348 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhodP97348 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RhodP97348 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhodP97348 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhodP97348 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhodP97348 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhodP97348 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhodP97348 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhodP97348 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhodP97348 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhodP97348 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhodP97348 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhodP97348 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhodP97348 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhodP97348 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RhodP97348 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhodP97348 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhodP97348 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhodP97348 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhodP97348 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RhodP97348 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhodP97348 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhodP97348 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms