Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist1h3bP84228 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist1h3bP84228 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms