Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx1P81068 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx1P81068 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx1P81068 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx1P81068 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx1P81068 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx1P81068 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx1P81068 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx1P81068 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms