Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx2P81066 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx2P81066 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx2P81066 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx2P81066 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx2P81066 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx2P81066 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms