Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cct4P80315 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cct4P80315 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct4P80315 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cct4P80315 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cct4P80315 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cct4P80315 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cct4P80315 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct4P80315 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cct4P80315 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms