Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

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Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sparcl1P70663 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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