Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tp53bp1P70399 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms