Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shox2P70390 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shox2P70390 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shox2P70390 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shox2P70390 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shox2P70390 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shox2P70390 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shox2P70390 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms