Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeboxP70368 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms