Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp4P70343 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp4P70343 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp4P70343 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp4P70343 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp4P70343 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp4P70343 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casp4P70343 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp4P70343 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp4P70343 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp4P70343 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms