Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aup1P70295 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aup1P70295 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aup1P70295 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aup1P70295 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aup1P70295 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aup1P70295 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aup1P70295 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aup1P70295 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aup1P70295 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms