Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms