Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp7P70280 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms