Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SbdsP70122 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SbdsP70122 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SbdsP70122 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms