Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Acta1P68134 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acta1P68134 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta1P68134 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms