Protein–RNA interactions for Protein: P68033

Actc1, Actin, alpha cardiac muscle 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actc1P68033 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actc1P68033 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actc1P68033 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actc1P68033 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actc1P68033 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actc1P68033 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actc1P68033 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms