Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb1P63158 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms