Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vamp2P63044 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms