Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vamp3P63024 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms