Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx1P63013 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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