Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms