Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RhobP62746 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RhobP62746 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RhobP62746 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhobP62746 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhobP62746 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhobP62746 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhobP62746 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhobP62746 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhobP62746 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhobP62746 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhobP62746 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhobP62746 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhobP62746 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhobP62746 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhobP62746 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhobP62746 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhobP62746 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhobP62746 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhobP62746 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhobP62746 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhobP62746 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhobP62746 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhobP62746 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhobP62746 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhobP62746 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhobP62746 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhobP62746 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhobP62746 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhobP62746 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhobP62746 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhobP62746 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhobP62746 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhobP62746 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhobP62746 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhobP62746 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhobP62746 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhobP62746 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhobP62746 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhobP62746 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhobP62746 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhobP62746 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhobP62746 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhobP62746 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhobP62746 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms