Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms