Protein–RNA interactions for Protein: P62342

Selenot, Thioredoxin reductase-like selenoprotein T, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenotP62342 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenotP62342 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenotP62342 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenotP62342 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenotP62342 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenotP62342 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenotP62342 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenotP62342 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenotP62342 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms