Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms