Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpd1P62315 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms