Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm3P62311 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms