Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo4P61969 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms