Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga11P61622 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga11P61622 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga11P61622 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga11P61622 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga11P61622 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga11P61622 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga11P61622 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341.1 ms