Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf13P61216 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf13P61216 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf13P61216 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1246.1 ms