Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps5P59438 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps5P59438 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hps5P59438 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms