Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcif1P59114 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms