Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Csrnp3P59055 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Csrnp3P59055 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp3P59055 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms