Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms