Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm6sf1P58749 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms